Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG67

Efr3a, Protein EFR3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3aQ8BG67 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Efr3aQ8BG67 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Efr3aQ8BG67 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Efr3aQ8BG67 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Efr3aQ8BG67 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Efr3aQ8BG67 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Efr3aQ8BG67 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Efr3aQ8BG67 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Efr3aQ8BG67 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efr3aQ8BG67 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efr3aQ8BG67 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efr3aQ8BG67 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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