Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG41

Psmb11, Proteasome subunit beta type-11, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb11Q8BG41 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb11Q8BG41 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb11Q8BG41 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms