Protein–RNA interactions for Protein: Q86VL8

SLC47A2, Multidrug and toxin extrusion protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC47A2Q86VL8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC47A2Q86VL8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC47A2Q86VL8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC47A2Q86VL8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC47A2Q86VL8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC47A2Q86VL8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms