Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PNMA8AQ86V59 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PNMA8AQ86V59 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNMA8AQ86V59 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PNMA8AQ86V59 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PNMA8AQ86V59 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PNMA8AQ86V59 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PNMA8AQ86V59 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PNMA8AQ86V59 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PNMA8AQ86V59 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PNMA8AQ86V59 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PNMA8AQ86V59 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PNMA8AQ86V59 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PNMA8AQ86V59 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PNMA8AQ86V59 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
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