Protein–RNA interactions for Protein: Q810F0

Prima1, Proline-rich membrane anchor 1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prima1Q810F0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prima1Q810F0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prima1Q810F0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Prima1Q810F0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prima1Q810F0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prima1Q810F0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prima1Q810F0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prima1Q810F0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prima1Q810F0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prima1Q810F0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prima1Q810F0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prima1Q810F0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prima1Q810F0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prima1Q810F0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms