Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp8Q80YR6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp8Q80YR6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp8Q80YR6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms