Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTU1Q7Z7A3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms