Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
YTHDF3Q7Z739 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDF3Q7Z739 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms