Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmc8Q7TN58 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms