Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms