Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot1Q6ZQ08 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot1Q6ZQ08 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnot1Q6ZQ08 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms