Protein–RNA interactions for Protein: Q6XE38

SCGB1D4, Secretoglobin family 1D member 4, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB1D4Q6XE38 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms