Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd300ld3Q6SJQ5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd300ld3Q6SJQ5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms