Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ecm29Q6PDI5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms