Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Trak1Q6PD31 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Trak1Q6PD31 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Trak1Q6PD31 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms