Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q6PD19 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q6PD19 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q6PD19 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q6PD19 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q6PD19 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q6PD19 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q6PD19 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q6PD19 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q6PD19 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q6PD19 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q6PD19 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q6PD19 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q6PD19 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q6PD19 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q6PD19 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q6PD19 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q6PD19 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q6PD19 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q6PD19 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q6PD19 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q6PD19 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q6PD19 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q6PD19 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q6PD19 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q6PD19 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q6PD19 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q6PD19 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Q6PD19 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q6PD19 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q6PD19 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q6PD19 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q6PD19 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q6PD19 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q6PD19 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q6PD19 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q6PD19 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q6PD19 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q6PD19 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q6PD19 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q6PD19 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q6PD19 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q6PD19 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q6PD19 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Q6PD19 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q6PD19 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q6PD19 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q6PD19 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q6PD19 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q6PD19 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q6PD19 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q6PD19 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q6PD19 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q6PD19 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q6PD19 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q6PD19 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q6PD19 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q6PD19 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q6PD19 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q6PD19 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q6PD19 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q6PD19 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q6PD19 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q6PD19 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q6PD19 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q6PD19 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q6PD19 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q6PD19 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q6PD19 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q6PD19 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q6PD19 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q6PD19 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q6PD19 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q6PD19 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q6PD19 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q6PD19 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q6PD19 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q6PD19 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q6PD19 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q6PD19 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q6PD19 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q6PD19 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q6PD19 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q6PD19 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q6PD19 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q6PD19 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q6PD19 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Q6PD19 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Q6PD19 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Q6PD19 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q6PD19 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q6PD19 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Q6PD19 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Q6PD19 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Q6PD19 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Q6PD19 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q6PD19 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q6PD19 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q6PD19 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q6PD19 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms