Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zbtb40Q6PCS8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zbtb40Q6PCS8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zbtb40Q6PCS8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
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