Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slf2Q6P9P0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Slf2Q6P9P0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slf2Q6P9P0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slf2Q6P9P0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms