Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5W5

SLC39A4, Zinc transporter ZIP4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A4Q6P5W5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC39A4Q6P5W5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC39A4Q6P5W5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC39A4Q6P5W5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms