Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3X3

TTC27, Tetratricopeptide repeat protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27Q6P3X3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC27Q6P3X3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC27Q6P3X3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms