Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Szrd1Q6NXN1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms