Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
U2surpQ6NV83 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2surpQ6NV83 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
U2surpQ6NV83 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.3 ms