Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ggnbp1Q6K1E7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms