Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RALGAPA1Q6GYQ0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RALGAPA1Q6GYQ0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms