Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ddx11Q6AXC6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ddx11Q6AXC6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ddx11Q6AXC6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddx11Q6AXC6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddx11Q6AXC6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddx11Q6AXC6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddx11Q6AXC6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddx11Q6AXC6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ddx11Q6AXC6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ddx11Q6AXC6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ddx11Q6AXC6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ddx11Q6AXC6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddx11Q6AXC6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms