Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rftn1Q6A0D4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rftn1Q6A0D4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms