Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sptbn2Q68FG2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sptbn2Q68FG2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sptbn2Q68FG2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms