Protein–RNA interactions for Protein: Q62191

Trim21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim21Q62191 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim21Q62191 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms