Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Ttf1Q62187 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Ttf1Q62187 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Ttf1Q62187 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
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Ttf1Q62187 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttf1Q62187 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Ttf1Q62187 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Ttf1Q62187 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttf1Q62187 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttf1Q62187 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttf1Q62187 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttf1Q62187 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Ttf1Q62187 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Ttf1Q62187 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Ttf1Q62187 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Ttf1Q62187 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttf1Q62187 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttf1Q62187 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Ttf1Q62187 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Ttf1Q62187 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Ttf1Q62187 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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