Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcd1Q61466 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcd1Q61466 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms