Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift88Q61371 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift88Q61371 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ift88Q61371 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ift88Q61371 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ift88Q61371 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ift88Q61371 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ift88Q61371 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift88Q61371 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift88Q61371 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift88Q61371 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift88Q61371 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift88Q61371 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift88Q61371 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift88Q61371 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift88Q61371 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ift88Q61371 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ift88Q61371 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms