Protein–RNA interactions for Protein: Q61249

Igbp1, Immunoglobulin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igbp1Q61249 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Igbp1Q61249 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Igbp1Q61249 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Igbp1Q61249 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Igbp1Q61249 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Igbp1Q61249 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Igbp1Q61249 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Igbp1Q61249 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Igbp1Q61249 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Igbp1Q61249 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Igbp1Q61249 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Igbp1Q61249 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Igbp1Q61249 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Igbp1Q61249 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Igbp1Q61249 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms