Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf4bQ61136 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prpf4bQ61136 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf4bQ61136 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms