Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnfrsf8Q60846 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnfrsf8Q60846 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnfrsf8Q60846 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnfrsf8Q60846 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnfrsf8Q60846 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnfrsf8Q60846 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnfrsf8Q60846 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnfrsf8Q60846 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnfrsf8Q60846 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnfrsf8Q60846 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnfrsf8Q60846 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnfrsf8Q60846 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnfrsf8Q60846 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnfrsf8Q60846 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnfrsf8Q60846 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnfrsf8Q60846 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnfrsf8Q60846 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms