Protein–RNA interactions for Protein: Q60662

Akap4, A-kinase anchor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap4Q60662 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Akap4Q60662 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Akap4Q60662 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Akap4Q60662 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Akap4Q60662 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Akap4Q60662 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Akap4Q60662 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Akap4Q60662 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Akap4Q60662 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Akap4Q60662 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Akap4Q60662 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Akap4Q60662 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Akap4Q60662 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Akap4Q60662 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Akap4Q60662 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Akap4Q60662 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Akap4Q60662 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Akap4Q60662 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Akap4Q60662 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Akap4Q60662 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Akap4Q60662 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Akap4Q60662 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Akap4Q60662 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms