Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prdm1Q60636 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm1Q60636 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm1Q60636 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms