Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE5

KRT79, Keratin, type II cytoskeletal 79, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT79Q5XKE5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT79Q5XKE5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT79Q5XKE5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms