Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RRAGBQ5VZM2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRAGBQ5VZM2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms