Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms