Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtp3Q5QGU6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms