Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rapgef6Q5NCJ1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rapgef6Q5NCJ1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rapgef6Q5NCJ1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Rapgef6Q5NCJ1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rapgef6Q5NCJ1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rapgef6Q5NCJ1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rapgef6Q5NCJ1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rapgef6Q5NCJ1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rapgef6Q5NCJ1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Rapgef6Q5NCJ1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rapgef6Q5NCJ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rapgef6Q5NCJ1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rapgef6Q5NCJ1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rapgef6Q5NCJ1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms