Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms