Protein–RNA interactions for Protein: Q5F204

Mdh1b, Putative malate dehydrogenase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdh1bQ5F204 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Mdh1bQ5F204 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mdh1bQ5F204 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mdh1bQ5F204 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mdh1bQ5F204 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mdh1bQ5F204 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mdh1bQ5F204 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdh1bQ5F204 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdh1bQ5F204 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdh1bQ5F204 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdh1bQ5F204 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdh1bQ5F204 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mdh1bQ5F204 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms