Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ODF2Q5BJF6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ODF2Q5BJF6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms