Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ESCO2Q56NI9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ESCO2Q56NI9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ESCO2Q56NI9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ESCO2Q56NI9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ESCO2Q56NI9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ESCO2Q56NI9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ESCO2Q56NI9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ESCO2Q56NI9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ESCO2Q56NI9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ESCO2Q56NI9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ESCO2Q56NI9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ESCO2Q56NI9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ESCO2Q56NI9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ESCO2Q56NI9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ESCO2Q56NI9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ESCO2Q56NI9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ESCO2Q56NI9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ESCO2Q56NI9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ESCO2Q56NI9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ESCO2Q56NI9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ESCO2Q56NI9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ESCO2Q56NI9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ESCO2Q56NI9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ESCO2Q56NI9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ESCO2Q56NI9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ESCO2Q56NI9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ESCO2Q56NI9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ESCO2Q56NI9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.1 ms