Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Shank3Q4ACU6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Shank3Q4ACU6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Shank3Q4ACU6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms