Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K9

Pls1, Plastin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls1Q3V0K9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pls1Q3V0K9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pls1Q3V0K9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms