Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp48Q3V0C5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp48Q3V0C5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
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