Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thsd4Q3UTY6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Thsd4Q3UTY6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms