Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prdm10Q3UTQ7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prdm10Q3UTQ7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prdm10Q3UTQ7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms